36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0136 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  71.37 
 
 		 227 aa  343  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  67.86 
 
 		 743 aa  320  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  57.21 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  57.87 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  54.88 
 
 		 223 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  56.28 
 
 		 730 aa  247  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  53.42 
 
 		 223 aa  247  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  50 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  51.63 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  51.16 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  54.42 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  50.9 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  50.45 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  45.33 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  49.09 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  50 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  45.79 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  45.91 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  44.65 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  42.4 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  40.74 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  43.06 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  30.35 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  24.26 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  22.01 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  25.7 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  24.3 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.35 
 
 		 650 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  21.65 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.17 
 
 		 647 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  27.35 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  32.1 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  24.29 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>