29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4043 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  57.66 
 
 		 226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  46.05 
 
 		 623 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  45.62 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  37.61 
 
 		 650 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.27 
 
 		 647 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  29.69 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  25 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  25.63 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  26.32 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.23 
 
 		 743 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  25.65 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  25.65 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  26.04 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  26.32 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  23.68 
 
 		 730 aa  72.4  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  25.13 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  24 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  27.46 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  22.77 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  21.58 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  24.23 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  21.64 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  22.34 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  24.58 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  24.37 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  20 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  26.83 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>