35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003614 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 227 aa  474  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  71.37 
 
 		 236 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.86 
 
 		 743 aa  307  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  58.6 
 
 		 216 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  56.74 
 
 		 221 aa  258  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  55.56 
 
 		 226 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  56.48 
 
 		 730 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  52.31 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  55.56 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  54.19 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  53.15 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  52.7 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  52.89 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  49.11 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  54.88 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  50.23 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  47.47 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  49.76 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  47.93 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  44.91 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  41.67 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  40.28 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  26.32 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  28.35 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  25.63 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.22 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.48 
 
 		 623 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  22.89 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  28.73 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  24.35 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.12 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1049  hypothetical protein  25.2 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.341067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>