24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0625 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  474  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  57.66 
 
 		 227 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  44.14 
 
 		 623 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  46.26 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.39 
 
 		 650 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.43 
 
 		 647 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  28.71 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  22.89 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  22.66 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  26.57 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  24.12 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  24.06 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  23.27 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  22.99 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  22.99 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  22.99 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.61 
 
 		 743 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  25.13 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  21.32 
 
 		 730 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  21.54 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  22.34 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  21.18 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.21 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  24.71 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>