36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0650 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  61.03 
 
 
217 aa  266  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  60.09 
 
 
226 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  59.62 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  59.15 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  61.03 
 
 
226 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  62.04 
 
 
217 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  52.47 
 
 
223 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  60.49 
 
 
218 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  55.05 
 
 
223 aa  244  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  56.81 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 
730 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  50.23 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  54.21 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  47.93 
 
 
227 aa  207  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  47.27 
 
 
223 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.2 
 
 
743 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  45.79 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  47.14 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  43.11 
 
 
226 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  40.19 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 
202 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  26.32 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.37 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.29 
 
 
650 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.22 
 
 
647 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.25 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  26.09 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.4 
 
 
623 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  32.73 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  23.56 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  21.54 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6802  hypothetical protein  30.53 
 
 
276 aa  45.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.238743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1172  hypothetical protein  32.99 
 
 
498 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>