34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3312 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  92.04 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  90.71 
 
 		 226 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  89.82 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  73.89 
 
 		 224 aa  347  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  67.28 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  60.35 
 
 		 730 aa  278  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  61.4 
 
 		 231 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  63.38 
 
 		 217 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  60.09 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  54.93 
 
 		 216 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  55.87 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  59.62 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  55.56 
 
 		 227 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  54.46 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  52.25 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.67 
 
 		 743 aa  228  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  51.16 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  51.42 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  49.07 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  44.04 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  42.52 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  39.91 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.56 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  25.13 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  25.22 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.78 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.37 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.89 
 
 		 623 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  22.16 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  24.78 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  24.06 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0926  TenA/THI-4 protein  30.43 
 
 		 130 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>