28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0391 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  49.77 
 
 
623 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  45.21 
 
 
227 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  46.26 
 
 
226 aa  198  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.39 
 
 
650 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.2 
 
 
647 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  29.56 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  25.23 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  27 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  24.87 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  27 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  28.92 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  25.25 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  26.05 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  26.11 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  24.34 
 
 
730 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  24.5 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  25.12 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  27.6 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  24.12 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.84 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.37 
 
 
743 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.79 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  23.71 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  26.24 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  24.53 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  23.12 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  24.87 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>