39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03394 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  100 
 
 		 223 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  71.36 
 
 		 223 aa  322  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  59.15 
 
 		 217 aa  265  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  57.21 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  56.76 
 
 		 730 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  52.7 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  52.25 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  52.34 
 
 		 216 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  55.05 
 
 		 229 aa  244  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  57.01 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  53.27 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  51.8 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  51.8 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  52.89 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52 
 
 		 743 aa  235  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  53.42 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  51.17 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  50.23 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  46.45 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  43.19 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  42.99 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  42.67 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  38.25 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  28.65 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  26.57 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  23.08 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  21.58 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.42 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  24.29 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.07 
 
 		 647 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.12 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  23.27 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.1 
 
 		 623 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1174  hypothetical protein  39.19 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0926  TenA/THI-4 protein  22.9 
 
 		 130 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1049  hypothetical protein  22.68 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.341067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1172  hypothetical protein  35.62 
 
 		 498 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  26.47 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  23.37 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>