37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3830 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  100 
 
 
223 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  71.36 
 
 
223 aa  322  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  59.15 
 
 
217 aa  278  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  57.01 
 
 
231 aa  265  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  58.53 
 
 
217 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  55.4 
 
 
216 aa  264  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  55.87 
 
 
226 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  57.84 
 
 
218 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  54.34 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  55.4 
 
 
226 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  54.34 
 
 
226 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  53.05 
 
 
221 aa  254  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  55.87 
 
 
730 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.62 
 
 
743 aa  250  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  54.19 
 
 
227 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  52.47 
 
 
229 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  54.88 
 
 
236 aa  244  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  52.02 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  51.18 
 
 
220 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  46.15 
 
 
223 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  44.2 
 
 
222 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  43.12 
 
 
226 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  36.62 
 
 
202 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.6 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  27.72 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.23 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  22.77 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.86 
 
 
623 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  26.79 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  24.34 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  24.12 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.99 
 
 
650 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  26.71 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.15 
 
 
647 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0926  TenA/THI-4 protein  26.15 
 
 
130 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1049  hypothetical protein  23.49 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.341067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  23.67 
 
 
226 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>