37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3944 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  67.13 
 
 		 221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  61.97 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  58.6 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  61.21 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  56.81 
 
 		 730 aa  264  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  55.4 
 
 		 223 aa  264  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  54.93 
 
 		 226 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  54.93 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  55.4 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  57.87 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  54.93 
 
 		 226 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  53.52 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.13 
 
 		 743 aa  250  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  54.21 
 
 		 231 aa  247  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  52.34 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  52.68 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  50.71 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  51.17 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  49.07 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  44.6 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  43.46 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  43.58 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  28.14 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  27.14 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.5 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  22.66 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  27.43 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  26.09 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.45 
 
 		 650 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22 
 
 		 647 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  21.16 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  26.62 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7726  hypothetical protein  26.32 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6288  hypothetical protein  23.23 
 
 		 240 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749089  normal  0.775588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6802  hypothetical protein  27.54 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.238743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>