27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1051 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  29.41 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  26.57 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  29.2 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  30.11 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  31.25 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  26.79 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
730 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  31.3 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  28.32 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  25.66 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  24.78 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  26.55 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  25.66 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  27.43 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  25.66 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  23.35 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  27.16 
 
 
226 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.97 
 
 
743 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  26.55 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  28.46 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  25.97 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1174  hypothetical protein  25.2 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  25.32 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  27.35 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>