33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3740 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  100 
 
 		 238 aa  497  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  39.9 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.341067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0926  TenA/THI-4 protein  46.09 
 
 		 130 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  28.35 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  27.72 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  27.8 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  26.03 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  28.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  30.38 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  30.38 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  27.14 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  25.22 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  26.45 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  25 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  27.33 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  24.37 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  23.08 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  26.09 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.11 
 
 		 743 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  25.62 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  28.34 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  25.55 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  22.44 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.88 
 
 		 650 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  27.34 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6802  hypothetical protein  27.82 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.238743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33 
 
 		 647 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  22.12 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3472  hypothetical protein  21.99 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2924  hypothetical protein  28.28 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>