31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02330 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  67.16 
 
 
217 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  67.32 
 
 
217 aa  261  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  60.29 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  59.62 
 
 
226 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  57.84 
 
 
223 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  59.42 
 
 
224 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  57.21 
 
 
223 aa  251  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  60.58 
 
 
231 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  60.1 
 
 
226 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  60.1 
 
 
226 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  60.49 
 
 
229 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  54.98 
 
 
730 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
216 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  49.76 
 
 
227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  49.51 
 
 
221 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  48.11 
 
 
220 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  49.49 
 
 
236 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.64 
 
 
743 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  46.86 
 
 
223 aa  198  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  42.04 
 
 
226 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  39.42 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 
202 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  27.37 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  25 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  31.25 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  21.64 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.22 
 
 
650 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.71 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.84 
 
 
647 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  22.65 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>