29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1285 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  100 
 
 		 226 aa  453  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  62.83 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  50.23 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  43.12 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  44.04 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  46.32 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  43.58 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  43.12 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  43.58 
 
 		 216 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  42.67 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  42.99 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  45.21 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  44.24 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  43.38 
 
 		 730 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  41.23 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  42.4 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  43.11 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  41.74 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  42.04 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  44.95 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.09 
 
 		 743 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  28.44 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  30.63 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  27.16 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  27.34 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6288  hypothetical protein  24.2 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749089  normal  0.775588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  26.83 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>