32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0546 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  75.47 
 
 		 220 aa  339  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  49.53 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  47.44 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  49.07 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  48.6 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  49.07 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  48.61 
 
 		 730 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  46.15 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  47.2 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  48.61 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  47.27 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  44.6 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  48.84 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  46.86 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  44.91 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  43.19 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  44.6 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  44.65 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 		 743 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  41.74 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  40.19 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  29.82 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  24.37 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.97 
 
 		 647 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.72 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  29.19 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  28.46 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  20 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6288  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749089  normal  0.775588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.53 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>