34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  70.51 
 
 		 217 aa  328  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  64.32 
 
 		 226 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  63.38 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  63.85 
 
 		 226 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  63.38 
 
 		 226 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  62.21 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  61.21 
 
 		 216 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  58.53 
 
 		 223 aa  280  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  67.32 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  60.37 
 
 		 730 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  62.04 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  60.19 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  57.01 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  54.88 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  56.34 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  54.42 
 
 		 236 aa  235  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.73 
 
 		 743 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  50.24 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  48.84 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  44.86 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  44.95 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  38.79 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  29.14 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  27.46 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  25.55 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26 
 
 		 650 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.56 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  27.43 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2173  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.68 
 
 		 623 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  24.53 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1174  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>