222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3795 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3795  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
338 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0839  hypothetical protein  30.24 
 
 
333 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0942104  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1241  Mammalian cell entry related domain protein  27.22 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4176  Mammalian cell entry related domain protein  27.2 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2244  virulence factor Mce family protein  28.65 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1218  Mammalian cell entry related domain protein  24.7 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  28.1 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2161  virulence factor Mce family protein  30.71 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4184  virulence factor Mce family protein  25.33 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2533  virulence factor MCE-like protein  31.16 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3667  virulence factor MCE-like protein  31.16 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3680  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2578  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3740  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2570  virulence factor Mce family protein  31.16 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4166  Fis family transcriptional regulator  26.55 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.802783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0138  virulence factor Mce family protein  28.42 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0963  hypothetical protein  25.59 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0122  virulence factor MCE-like protein  29.28 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0131  virulence factor Mce family protein  29.28 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307486  normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1172  virulence factor Mce family protein  36.03 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0112  virulence factor Mce family protein  29.28 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2820  virulence factor Mce family protein  29.32 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10174  MCE family lipoprotein LprK  26.79 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4342  virulence factor Mce family protein  24.78 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10605  MCE family lipoprotein LprL  27.2 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.961449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1631  virulence factor Mce family protein  29.15 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.879695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1658  virulence factor MCE-like protein  29.15 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1682  virulence factor Mce family protein  29.15 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0517  virulence factor Mce family protein  29.15 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4395  virulence factor Mce family protein  29.91 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0707  virulence factor Mce family protein  27.59 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4996  virulence factor Mce family protein  29.41 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.401829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0648  virulence factor Mce family protein  29.15 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4613  virulence factor MCE-like protein  29.41 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4701  virulence factor Mce family protein  29.41 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0926  virulence factor Mce family protein  25.81 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0006  hypothetical protein  25.36 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2982  Mammalian cell entry related domain protein  28.04 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0707  virulence factor Mce family protein  27.72 
 
 
472 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.953173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  28.7 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2855  virulence factor Mce family protein  28.57 
 
 
399 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167049  normal  0.278595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1134  virulence factor Mce family protein  27.12 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4146  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 
445 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  36.11 
 
 
155 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2512  virulence factor Mce family protein  29.83 
 
 
443 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12001  MCE family lipoprotein LprM  27.84 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000209342  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  34.29 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  34.29 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  35.35 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  31.78 
 
 
186 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  25.09 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4145  virulence factor Mce family protein  26.5 
 
 
561 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3019  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  27.84 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  31.01 
 
 
181 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13529  MCE family lipoprotein LprN  26.05 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  37 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  29.76 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  31.76 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  31.67 
 
 
148 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1528  virulence factor MCE-like protein  27.07 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.246069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1551  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.301578  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  26.98 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4600  virulence factor Mce family protein  22.47 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0367  virulence factor Mce family protein  24.86 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  29.66 
 
 
164 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  26.06 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  24.68 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0703  virulence factor Mce family protein  27.14 
 
 
425 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  26.74 
 
 
437 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  32.73 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  29.29 
 
 
149 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0647  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
484 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  35.64 
 
 
174 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  35.29 
 
 
155 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  37.62 
 
 
196 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2157  virulence factor Mce family protein  26.96 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00120827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1659  virulence factor MCE-like protein  24.69 
 
 
484 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  25.53 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  26.7 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1632  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 
484 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175029  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1683  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 
484 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  26.7 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0518  virulence factor Mce family protein  24.69 
 
 
484 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.608059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3978  virulence factor Mce family protein  23.73 
 
 
380 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.517542  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  26.14 
 
 
580 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
184 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  34.31 
 
 
155 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
188 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
186 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3946  virulence factor Mce family protein  28.06 
 
 
433 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
186 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  32.32 
 
 
189 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  32.32 
 
 
186 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.32 
 
 
186 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>