196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2982 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2982  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
381 aa  757    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0963  hypothetical protein  33.69 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0006  hypothetical protein  32.43 
 
 
413 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4342  virulence factor Mce family protein  29.9 
 
 
440 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4176  Mammalian cell entry related domain protein  32.55 
 
 
345 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1172  virulence factor Mce family protein  30.59 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2820  virulence factor Mce family protein  25.68 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3978  virulence factor Mce family protein  26.19 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.517542  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1241  Mammalian cell entry related domain protein  25.67 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4184  virulence factor Mce family protein  26.17 
 
 
379 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4166  Fis family transcriptional regulator  25.38 
 
 
380 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.802783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0707  virulence factor Mce family protein  29.07 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.953173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  25.96 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  24.71 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1134  virulence factor Mce family protein  27.15 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4146  virulence factor Mce family protein  25.83 
 
 
445 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1218  Mammalian cell entry related domain protein  26.87 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2512  virulence factor Mce family protein  25.47 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0367  virulence factor Mce family protein  25.43 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1658  virulence factor MCE-like protein  24.09 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1682  virulence factor Mce family protein  24.09 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0517  virulence factor Mce family protein  24.09 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348631  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0648  virulence factor Mce family protein  24.09 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0707  virulence factor Mce family protein  27.31 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1631  virulence factor Mce family protein  24.09 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.879695  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0926  virulence factor Mce family protein  26.5 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4600  virulence factor Mce family protein  25.26 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0138  virulence factor Mce family protein  26.64 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12001  MCE family lipoprotein LprM  24.91 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000209342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2161  virulence factor Mce family protein  24.82 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3795  Mammalian cell entry related domain protein  27.9 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2855  virulence factor Mce family protein  26.74 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.167049  normal  0.278595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0270  virulence factor Mce family protein  25.19 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0279  virulence factor MCE-like protein  25.19 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0289  virulence factor Mce family protein  25.19 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0516  virulence factor Mce family protein  24.36 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3019  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  28.18 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0514  virulence factor Mce family protein  33.33 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2533  virulence factor MCE-like protein  25.84 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2578  virulence factor Mce family protein  25.84 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1528  virulence factor MCE-like protein  24.81 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.246069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3667  virulence factor MCE-like protein  25.84 
 
 
454 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4613  virulence factor MCE-like protein  25.43 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1551  virulence factor Mce family protein  24.81 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.301578  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3740  virulence factor Mce family protein  25.84 
 
 
454 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4701  virulence factor Mce family protein  25.43 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2570  virulence factor Mce family protein  25.84 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3680  virulence factor Mce family protein  25.84 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10605  MCE family lipoprotein LprL  26.09 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.961449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4534  virulence factor Mce family protein  24.63 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000769864  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  26.11 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2983  virulence factor Mce family protein  24.41 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  26.43 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  27.93 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3824  virulence factor Mce family protein  24.62 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2244  virulence factor Mce family protein  24.39 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3946  virulence factor Mce family protein  22.36 
 
 
433 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3823  virulence factor Mce family protein  22.3 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13529  MCE family lipoprotein LprN  24.63 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10174  MCE family lipoprotein LprK  23.25 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0112  virulence factor Mce family protein  27.82 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0122  virulence factor MCE-like protein  28.77 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0131  virulence factor Mce family protein  28.77 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307486  normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4996  virulence factor Mce family protein  24.05 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.401829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0513  virulence factor Mce family protein  24.52 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0839  hypothetical protein  31.72 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0942104  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  24.65 
 
 
430 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  39.56 
 
 
158 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  35.71 
 
 
181 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1625  Mammalian cell entry related domain protein  26.26 
 
 
559 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.164573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  24.26 
 
 
584 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  24.26 
 
 
584 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0515  virulence factor Mce family protein  24.08 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  34.82 
 
 
186 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  33.81 
 
 
153 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  23.25 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2245  virulence factor Mce family protein  24.4 
 
 
450 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  31.91 
 
 
173 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  31.65 
 
 
152 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  35.35 
 
 
184 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  23.76 
 
 
565 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  32.35 
 
 
161 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2105  virulence factor Mce family protein  23.84 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  30.15 
 
 
175 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  26.43 
 
 
152 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.05 
 
 
523 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  32.17 
 
 
155 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0280  virulence factor MCE-like protein  22.13 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0290  virulence factor Mce family protein  22.13 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.6 
 
 
529 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0271  virulence factor Mce family protein  22.13 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.35 
 
 
176 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  30.15 
 
 
175 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3949  virulence factor Mce family protein  26.48 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  33.98 
 
 
152 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  33.98 
 
 
152 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  30.36 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  30.36 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  34.29 
 
 
160 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>