43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1682 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  87.95 
 
 		 249 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  82.33 
 
 		 249 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  82 
 
 		 265 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  54.29 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  44.21 
 
 		 247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  32.28 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.19 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  32.38 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.97 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.15 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.27 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.53 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  28.23 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  25.91 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  29.44 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.32 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  28.63 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  30.08 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  29.49 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  29.96 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  29.17 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.21 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  27.64 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  28.63 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.86 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  22.71 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  30.61 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  28.34 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  29.54 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  28.23 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.86 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  28.81 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  23.05 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.39 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  27.76 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  27.27 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  27.98 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.98 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  22.95 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  26.74 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  22.58 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.53 
 
 		 379 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>