26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0051 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  40.96 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.39 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.39 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.98 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.29 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  21.91 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  24.11 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.67 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  20.73 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  23.32 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.23 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.62 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  24.9 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  21.58 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  25.3 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  25.29 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  22.76 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.83 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  20 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  20 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  21.72 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  22.46 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.58 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  23.75 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>