42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0699 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  67.6 
 
 
249 aa  345  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  65.34 
 
 
250 aa  337  9e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  64.54 
 
 
250 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  64.54 
 
 
250 aa  332  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  34.26 
 
 
245 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  33.07 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  33.86 
 
 
245 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  33.6 
 
 
244 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  32.54 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.86 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.97 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  30.16 
 
 
247 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  35.92 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.15 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  29.37 
 
 
247 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.51 
 
 
255 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.92 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  30.95 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  30.16 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  29.76 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.92 
 
 
248 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  32.28 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  30.16 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  30.61 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  30.31 
 
 
247 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  28.17 
 
 
247 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  28.29 
 
 
261 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  28.57 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  25.1 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  26.64 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.151772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.29 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.56 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  24.6 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  26.61 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  24.44 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  26.37 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.18 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  26.38 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  25.56 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  25.67 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  21.78 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>