42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0960 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  96.4 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  97.6 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  90 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  65.34 
 
 		 247 aa  337  9e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  32.02 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  31.5 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  29.92 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.96 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  30.86 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.46 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.81 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  30.74 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  32.94 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.27 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  31.25 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  29.69 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  30.08 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  29.3 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.53 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  27.56 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.72 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.91 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.72 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  28.91 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  28.16 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  25.81 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  27.73 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  27.42 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.9 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  26.51 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.25 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  27.64 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  25.1 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  23.66 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  23.01 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  21.94 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  24.31 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  23.25 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  20.09 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.62 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  20.34 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>