43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0990 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  82.4 
 
 		 249 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  82 
 
 		 249 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  80.4 
 
 		 249 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  52.65 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  43.6 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  32.16 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  33.76 
 
 		 248 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  32.24 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.43 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.61 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.63 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.71 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  31.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  27.71 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  29.72 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  30.12 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.91 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  30.38 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.82 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  29.91 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  28.63 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  29.84 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  29.72 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.51 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  29.03 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  22.05 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  24.79 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  31.51 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  29.41 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  29.32 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  22.95 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  25.91 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.57 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.98 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.57 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  27.46 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  27.57 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  24.08 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  25.3 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  22.71 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  25 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>