40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1792 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  53.47 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.11 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.94 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.52 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.64 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.23 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.9 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.27 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  23.14 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.6 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  24.79 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.87 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  22.22 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.01 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.7 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  23.77 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  24.1 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  21.52 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.18 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  23.01 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  25.61 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  22.82 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  22.73 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  23.87 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  25.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  23.27 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  23.65 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  22.54 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  24.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  24.08 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  23.27 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  20.18 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  23.92 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.58 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  22.71 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  22.98 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  21.37 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  22.34 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  17.46 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>