35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00880 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  100 
 
 
343 aa  689    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  51.03 
 
 
261 aa  222  9e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  48.95 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  46.32 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.09 
 
 
248 aa  86.7  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.87 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.56 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  24.56 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.98 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.61 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.85 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.37 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.74 
 
 
249 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.06 
 
 
247 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  19.61 
 
 
245 aa  57  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.42 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.26 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  27.36 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  21.71 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  23.84 
 
 
256 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  27.08 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  23.33 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.86 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  26.57 
 
 
247 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  20.97 
 
 
244 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  25.15 
 
 
247 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  40 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  25.83 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  21.76 
 
 
293 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  42 
 
 
245 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  23.86 
 
 
265 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  20.99 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  20.79 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  27.12 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  22.22 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>