39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2041 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  100 
 
 
247 aa  490  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  93.12 
 
 
247 aa  461  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  79.35 
 
 
261 aa  398  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  78.95 
 
 
247 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  75.3 
 
 
247 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  64.78 
 
 
247 aa  323  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  49.8 
 
 
245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  50.61 
 
 
244 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  49.8 
 
 
245 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  43.32 
 
 
247 aa  226  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  41.7 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  41.7 
 
 
247 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  40.49 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  37.65 
 
 
247 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.54 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  34.21 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.73 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.3 
 
 
250 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.52 
 
 
250 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.52 
 
 
250 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.6 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.76 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.76 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.9 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.02 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.86 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  24.43 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  26.62 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.52 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  24.7 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.17 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  22.41 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.74 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  22.49 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  23.05 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  24.1 
 
 
257 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  23.35 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  22.41 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  22.22 
 
 
343 aa  45.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>