39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0162 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  100 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  93.12 
 
 		 247 aa  461  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  78.95 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  78.95 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  74.09 
 
 		 247 aa  371  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  68.42 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  51.01 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  51.42 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  48.99 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  42.51 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  42.11 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  43.32 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  42.51 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  38.87 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  33.07 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  35.09 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.27 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.86 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  30.08 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.08 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.86 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.35 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.22 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.16 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.07 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  24.43 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.57 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  25.1 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.1 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  23.24 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  25.1 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.36 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.44 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  23.69 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  23.62 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  22.55 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  25.15 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.89 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  20.33 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>