35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1488 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  60.32 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  57.09 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  59.11 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  53.85 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  38.87 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  38.46 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  37.65 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  37.25 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  35.63 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  35.37 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  37.25 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  37.55 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  34.01 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  34.87 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.94 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  29.3 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.69 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.66 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.28 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.75 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.17 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.94 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  26.97 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.2 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  21.62 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.2 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.1 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  20.56 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  24.08 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.66 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  23.64 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  18.73 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  20.79 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  23.89 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>