41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2653 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  78.14 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  75.3 
 
 		 247 aa  378  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  76.92 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  74.09 
 
 		 247 aa  371  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  67.61 
 
 		 247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  45.75 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  46.15 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  46.96 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  37.65 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  39.68 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  39.68 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  37.25 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  38.46 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.77 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.95 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.41 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.52 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.52 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.91 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  26.44 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.54 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.71 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.41 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.99 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  26.44 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.57 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.73 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.1 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  22.96 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  24.07 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  22.54 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.39 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.69 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  22.55 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.11 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  26.57 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  23.08 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  20.6 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  23.95 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.75 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>