40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1648 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  84.62 
 
 		 261 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  78.95 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  78.95 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  78.14 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  66.4 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  46.96 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  46.96 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  46.96 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  40.49 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  41.7 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  40.08 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  40.89 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  35.63 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.14 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.37 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.27 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.56 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.77 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  26.77 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.29 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.81 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.57 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.25 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.25 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  30.67 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  23.28 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  26.79 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.13 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  27.09 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  24.1 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  23.89 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.59 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.31 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  24.7 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  23.39 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  21.48 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  20.17 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  27.12 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  22.89 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>