42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0042 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  39.76 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  39.2 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  37.75 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  36.95 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  33.33 
 
 		 247 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.14 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.28 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.71 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  31.37 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.31 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.12 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.81 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.81 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.8 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  25.81 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.42 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.1 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.4 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  25.3 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  23.14 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  24.27 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  24.48 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  23.02 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  23.43 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  21.32 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  23.89 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.24 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  22.41 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  21.58 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  25.93 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  19.92 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  19.67 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  24.07 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  20.56 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  23.24 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  22.41 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  22.5 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  18.43 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  19.05 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  21.76 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  21.34 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>