23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1375 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  40.96 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.2 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.11 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  24.71 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.31 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  21.32 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.38 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.31 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.89 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.18 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.61 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  22.58 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.39 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  21.05 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  22.71 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  22.64 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  23.55 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  19.34 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  24.12 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  21.43 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  20.9 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.08 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>