More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1335 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1335  methyltransferase GidB  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0873735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1778  methyltransferase GidB  44.13 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  39.81 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  39.81 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  38.12 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.18 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  34.18 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  35.32 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.81 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  35.64 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  34.31 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3195  methyltransferase GidB  34.31 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2756  methyltransferase GidB  35.61 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  37.88 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  30.7 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.5 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  34.55 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  28.36 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  30.7 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  30.2 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0327  methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  32.84 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  31.5 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  32.26 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  30.69 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  30.33 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.35 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28500  glucose-inhibited division protein B  35.32 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.11518  hitchhiker  0.00103054 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.34 
 
 		 241 aa  92  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  30.35 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  29.3 
 
 		 235 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  32.18 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1851  methyltransferase GidB  30.1 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1555  methyltransferase GidB  30.35 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  30.28 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1005  16S rRNA methyltransferase GidB  29.11 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  34 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  30.92 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  37.68 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3880  16S rRNA methyltransferase GidB  29.47 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.480171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18741  16S rRNA methyltransferase GidB  29.11 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.947759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  27.23 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2928  methyltransferase GidB  29.74 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  35.95 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  32.88 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2128  methyltransferase GidB  32.49 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  36.5 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3211  methyltransferase GidB  30.48 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0267  16S rRNA methyltransferase GidB  28.86 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  30.5 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  32.58 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2084  methyltransferase GidB  32.49 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  27.5 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  31.46 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30.39 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30.39 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.34 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  29.88 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.56 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  34.75 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  34.72 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  34.04 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  34.56 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  31.47 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  29.27 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3119  methyltransferase GidB  28.17 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101436  hitchhiker  0.000000233712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  29.27 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  34.53 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  37.88 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  28.5 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1364  methyltransferase GidB  31.22 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>