116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3103 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3103  Methyltransferase type 12  100 
 
 
275 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00714601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  42.11 
 
 
261 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0601  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  37.21 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  22.94 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.28 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  29.87 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.21 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  25.12 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  31.33 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  29.66 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  27.22 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  28.4 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  23.6 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  35.4 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.91 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  26.53 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  27.17 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.27 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  23.53 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  34.92 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.54 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.64 
 
 
228 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  32.2 
 
 
261 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  29.45 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  26.21 
 
 
241 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  25.67 
 
 
388 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
191 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.15 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  41.57 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  31.18 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.12 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.49 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.18 
 
 
232 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  26.87 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  22.7 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  25.49 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  25.56 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.47 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  34.07 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.96 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  25.41 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  23.4 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  30.11 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.37 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  42.25 
 
 
446 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.42 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.9 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.63 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  25.64 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.57 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.15 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  20.37 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  34.94 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  26.72 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
226 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
217 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03520  protein arginine n-methyltransferase, putative  27.33 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0885983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>