More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0943 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  56.1 
 
 		 777 aa  730    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  50.36 
 
 		 720 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  52.64 
 
 		 643 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 697 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  50.36 
 
 		 725 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 670 aa  1348    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  50.59 
 
 		 674 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  52.82 
 
 		 706 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  52.6 
 
 		 722 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  50.59 
 
 		 674 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  51.48 
 
 		 674 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  55.04 
 
 		 694 aa  707    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  51.88 
 
 		 741 aa  657    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  50.59 
 
 		 674 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  50.45 
 
 		 686 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  50.07 
 
 		 680 aa  662    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  55.22 
 
 		 770 aa  740    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  52.52 
 
 		 745 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  50.59 
 
 		 674 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.63 
 
 		 697 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  50.57 
 
 		 707 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  50.45 
 
 		 721 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  50.51 
 
 		 710 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  50.51 
 
 		 710 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  58.17 
 
 		 725 aa  749    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 645 aa  693    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  52.16 
 
 		 719 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 697 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.12 
 
 		 746 aa  641    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 740 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  50.93 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  50.86 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  49.56 
 
 		 760 aa  623  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  47.81 
 
 		 678 aa  608  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  51.55 
 
 		 685 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  47.18 
 
 		 829 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  50.45 
 
 		 702 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 		 755 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  47.44 
 
 		 703 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  52.09 
 
 		 745 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.89 
 
 		 687 aa  598  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  48.86 
 
 		 698 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  51.08 
 
 		 648 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  44.33 
 
 		 679 aa  575  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  43 
 
 		 695 aa  542  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 		 768 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 		 768 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 792 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 767 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  42.68 
 
 		 795 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  42.81 
 
 		 818 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 845 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  42.53 
 
 		 795 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 		 811 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 813 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  42.99 
 
 		 818 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  42.53 
 
 		 796 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 857 aa  513  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  43.32 
 
 		 697 aa  510  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  41.02 
 
 		 823 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.75 
 
 		 695 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 		 814 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 		 814 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 		 775 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  41.62 
 
 		 698 aa  508  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  41.23 
 
 		 813 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 		 806 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  44.49 
 
 		 793 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  40.79 
 
 		 889 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 817 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  39.97 
 
 		 680 aa  458  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 894 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 		 818 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 		 801 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40.6 
 
 		 831 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 		 831 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 		 776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  40.65 
 
 		 732 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 		 872 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.86 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  39.88 
 
 		 818 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 		 973 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  37.81 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  37.95 
 
 		 786 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.83 
 
 		 758 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  40.27 
 
 		 837 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  37.71 
 
 		 735 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  38.46 
 
 		 736 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  40.47 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  39.73 
 
 		 767 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  38.62 
 
 		 822 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.4 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  39.07 
 
 		 760 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 889 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 		 837 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  37.72 
 
 		 781 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 		 823 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>