More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4491 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  69.23 
 
 
813 aa  1002    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  60.22 
 
 
814 aa  974    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  60.22 
 
 
814 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  56.49 
 
 
775 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  60.21 
 
 
811 aa  1006    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  54.03 
 
 
768 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  67.41 
 
 
813 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  69.13 
 
 
792 aa  970    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  68.81 
 
 
817 aa  959    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  54.89 
 
 
795 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  47.71 
 
 
845 aa  702    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  71.15 
 
 
818 aa  992    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  50.2 
 
 
818 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  55.03 
 
 
795 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  54.03 
 
 
768 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  55.03 
 
 
796 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  54.81 
 
 
767 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
889 aa  1771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  59.51 
 
 
823 aa  1005    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  45.46 
 
 
857 aa  633  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  49.35 
 
 
806 aa  614  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
793 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  46.43 
 
 
954 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
851 aa  572  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 
857 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.43 
 
 
836 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
889 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
894 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
942 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.97 
 
 
889 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
818 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  45.43 
 
 
643 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
753 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 
758 aa  526  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
795 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  45.92 
 
 
809 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
867 aa  525  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
752 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
680 aa  525  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
674 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  46.25 
 
 
872 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
750 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
674 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
755 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
827 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  45.05 
 
 
804 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  40.93 
 
 
740 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
810 aa  515  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 
818 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  45.8 
 
 
814 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 
814 aa  515  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
817 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  45.8 
 
 
814 aa  512  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
674 aa  512  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
821 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
759 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.75 
 
 
837 aa  507  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
759 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  45.84 
 
 
801 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  42.88 
 
 
742 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.4 
 
 
849 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
816 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  45.63 
 
 
715 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
737 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 
773 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 
839 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  42.53 
 
 
815 aa  502  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  42.06 
 
 
767 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
686 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
781 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
781 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
758 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.9 
 
 
797 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
833 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
743 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
721 aa  499  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  41.26 
 
 
829 aa  497  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
837 aa  498  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
747 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
821 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  45.84 
 
 
833 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  45.54 
 
 
806 aa  499  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
837 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  44.54 
 
 
788 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  44.29 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  43.94 
 
 
736 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.84 
 
 
835 aa  495  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  41.44 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.02 
 
 
820 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
816 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
815 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
973 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
782 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
815 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
786 aa  496  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
755 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  41 
 
 
735 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
724 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>