More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1513 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  64.33 
 
 
818 aa  1034    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  78.26 
 
 
792 aa  1240    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  52.82 
 
 
795 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
806 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  65.96 
 
 
813 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
817 aa  1650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  65.07 
 
 
811 aa  1033    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  52.8 
 
 
775 aa  739    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  45.79 
 
 
857 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  69.26 
 
 
814 aa  1088    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  51.81 
 
 
768 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  69.26 
 
 
814 aa  1088    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  64.58 
 
 
813 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  52.48 
 
 
818 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  52.69 
 
 
795 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  51.81 
 
 
768 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  51.96 
 
 
845 aa  765    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  52.69 
 
 
796 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  50.81 
 
 
767 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  69.6 
 
 
889 aa  969    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  80.95 
 
 
823 aa  1337    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 
793 aa  621  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.55 
 
 
954 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
889 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.98 
 
 
889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
857 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
818 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
894 aa  545  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  38.84 
 
 
942 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  45.7 
 
 
795 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 
814 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  40.37 
 
 
817 aa  532  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
821 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  39.45 
 
 
851 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  45.27 
 
 
643 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  40.73 
 
 
837 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
758 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
816 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  44.68 
 
 
804 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
821 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.92 
 
 
753 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  43.69 
 
 
752 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
786 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
680 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.43 
 
 
831 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  39.23 
 
 
755 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
837 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  40.24 
 
 
827 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  41.55 
 
 
814 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  39.52 
 
 
740 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
828 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  43.2 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.89 
 
 
750 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  43.2 
 
 
674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.45 
 
 
815 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  44.36 
 
 
905 aa  515  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
872 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
743 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  41.83 
 
 
814 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 
836 aa  515  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  46.19 
 
 
976 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
867 aa  514  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
828 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
798 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  43.91 
 
 
781 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  43.91 
 
 
781 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  43.56 
 
 
806 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  37.41 
 
 
805 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  42.12 
 
 
674 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
788 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
760 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
818 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
759 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
759 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  42.12 
 
 
674 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  42.27 
 
 
674 aa  505  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  43.93 
 
 
809 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.88 
 
 
814 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 
787 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 
823 aa  505  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  45.77 
 
 
715 aa  505  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  43.79 
 
 
801 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  44.14 
 
 
644 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
849 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  38.93 
 
 
735 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  40.94 
 
 
829 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
755 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
797 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
755 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  41.2 
 
 
796 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.41 
 
 
806 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
786 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
806 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
797 aa  502  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  41.99 
 
 
735 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  43.19 
 
 
767 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
670 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
737 aa  499  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>