More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0167 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  58.49 
 
 		 680 aa  821    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  55.75 
 
 		 686 aa  748    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  53.62 
 
 		 694 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  61.36 
 
 		 829 aa  850    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  67.7 
 
 		 689 aa  858    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 670 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  70.57 
 
 		 643 aa  919    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  92.58 
 
 		 674 aa  1262    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  93.47 
 
 		 674 aa  1268    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  93.47 
 
 		 674 aa  1268    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  57.29 
 
 		 740 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  55.59 
 
 		 755 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  92.58 
 
 		 674 aa  1262    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  62.44 
 
 		 703 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  64.44 
 
 		 721 aa  882    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  66.21 
 
 		 678 aa  841    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  61.01 
 
 		 698 aa  776    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 674 aa  1350    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 777 aa  631  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 770 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.15 
 
 		 687 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  45.52 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  51.62 
 
 		 725 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  51.15 
 
 		 741 aa  598  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 695 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  48.16 
 
 		 706 aa  582  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  51.62 
 
 		 648 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  45.93 
 
 		 707 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  52.87 
 
 		 645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 720 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  46.3 
 
 		 710 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 697 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.54 
 
 		 697 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 697 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 710 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  45.81 
 
 		 725 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  47.65 
 
 		 722 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 697 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  45.77 
 
 		 760 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 705 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 719 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 768 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 768 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  49.46 
 
 		 745 aa  545  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 		 745 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  43.89 
 
 		 818 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  43 
 
 		 813 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 746 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 685 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 811 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 845 aa  526  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  44.51 
 
 		 767 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  42.27 
 
 		 813 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  42.92 
 
 		 792 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  44.15 
 
 		 795 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.08 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  44.31 
 
 		 795 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 702 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  45.03 
 
 		 793 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 		 889 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  41.98 
 
 		 823 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  45.25 
 
 		 775 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  41.52 
 
 		 698 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  44.01 
 
 		 806 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  41.41 
 
 		 697 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 		 818 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  44.31 
 
 		 796 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  41.97 
 
 		 817 aa  502  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 		 857 aa  501  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 		 814 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 		 814 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.57 
 
 		 695 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  40.83 
 
 		 680 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  41.84 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 		 755 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 851 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 		 823 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 868 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  40.57 
 
 		 809 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 801 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 		 836 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 818 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 806 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.67 
 
 		 894 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  40.44 
 
 		 803 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 786 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.49 
 
 		 795 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 		 797 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 762 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.52 
 
 		 787 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  37.94 
 
 		 683 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 		 810 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  40.82 
 
 		 804 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 781 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  37.03 
 
 		 822 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 781 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 846 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  38.09 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  37.94 
 
 		 743 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>