More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3055 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  49.52 
 
 
720 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  52.36 
 
 
706 aa  670    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  53.7 
 
 
643 aa  649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  56.33 
 
 
694 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  48.77 
 
 
829 aa  648    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  69.35 
 
 
770 aa  938    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  50.42 
 
 
710 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  56.86 
 
 
670 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
777 aa  1568    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  50.35 
 
 
707 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  51.75 
 
 
745 aa  654    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  50.45 
 
 
680 aa  676    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
746 aa  651    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  49.73 
 
 
760 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.05 
 
 
697 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  54.44 
 
 
725 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  52.19 
 
 
697 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  61.74 
 
 
741 aa  835    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  50.28 
 
 
710 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  52.05 
 
 
697 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  49.31 
 
 
725 aa  638    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  47.36 
 
 
721 aa  634  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
697 aa  634  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
674 aa  631  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
674 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
674 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  50.5 
 
 
702 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
740 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 
674 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 
674 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  51.85 
 
 
705 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  55.95 
 
 
645 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  48.9 
 
 
686 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
722 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  47.13 
 
 
755 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  48.91 
 
 
697 aa  618  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
647 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  50.07 
 
 
685 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  51.25 
 
 
719 aa  615  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 
689 aa  611  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  52.31 
 
 
745 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  54 
 
 
648 aa  601  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  50.22 
 
 
678 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  49.08 
 
 
703 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 
698 aa  588  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.06 
 
 
687 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  43.07 
 
 
679 aa  566  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  45.06 
 
 
695 aa  552  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
813 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  41.83 
 
 
811 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
814 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
814 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  42.04 
 
 
813 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  42.98 
 
 
793 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  41.64 
 
 
818 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
795 aa  492  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  40.96 
 
 
698 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  42.92 
 
 
857 aa  492  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
795 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.9 
 
 
695 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
768 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
768 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
796 aa  482  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  40.43 
 
 
697 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
792 aa  475  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
767 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  39.16 
 
 
845 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  38.11 
 
 
889 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  39.91 
 
 
817 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  38.44 
 
 
680 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 
818 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
775 aa  459  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  37.62 
 
 
732 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 
806 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  38.57 
 
 
683 aa  452  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 
758 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
823 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
894 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  40.24 
 
 
724 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
795 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.5 
 
 
735 aa  439  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  38.43 
 
 
809 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  37.84 
 
 
735 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
755 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.86 
 
 
787 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
838 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  40.52 
 
 
804 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
806 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
801 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
809 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  38.53 
 
 
736 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
772 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
818 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
846 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
836 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
760 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
846 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
839 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>