More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3876 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  84.05 
 
 
698 aa  1067    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  61.55 
 
 
674 aa  823    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  52.01 
 
 
770 aa  638    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  63.82 
 
 
643 aa  823    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  54.92 
 
 
829 aa  764    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 
674 aa  824    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  52.97 
 
 
740 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
689 aa  823    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  55.64 
 
 
686 aa  739    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  50.86 
 
 
694 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 
755 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
703 aa  1415    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  58.2 
 
 
678 aa  736    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  53.74 
 
 
680 aa  751    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 
674 aa  824    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  62.2 
 
 
674 aa  825    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  61.55 
 
 
674 aa  823    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 
777 aa  635    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  54.84 
 
 
721 aa  752    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
670 aa  618  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  51.79 
 
 
741 aa  596  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  50.86 
 
 
725 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  48.57 
 
 
706 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  45.09 
 
 
679 aa  565  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  46.59 
 
 
710 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.43 
 
 
687 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  46.45 
 
 
710 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  46.82 
 
 
720 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 
725 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  48.68 
 
 
707 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  46.71 
 
 
695 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
760 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
648 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  47.15 
 
 
697 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.15 
 
 
697 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  47.15 
 
 
697 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  46.64 
 
 
697 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  48.38 
 
 
719 aa  542  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
645 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.38 
 
 
745 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
685 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
813 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.89 
 
 
746 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
745 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
705 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
792 aa  525  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
811 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  43.06 
 
 
818 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
722 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.07 
 
 
697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  46.95 
 
 
702 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
813 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
889 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.94 
 
 
647 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
823 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
814 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
814 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
768 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
817 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
768 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
767 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
806 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
793 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
857 aa  480  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  39.32 
 
 
680 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
845 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  41.89 
 
 
697 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  41.42 
 
 
698 aa  473  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  42.29 
 
 
795 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  41.7 
 
 
818 aa  475  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  42.44 
 
 
795 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.27 
 
 
695 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  40 
 
 
732 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  42.44 
 
 
796 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
775 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  35.78 
 
 
683 aa  439  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
795 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
823 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
755 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
818 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
894 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
811 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
851 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.64 
 
 
804 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
806 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  39.38 
 
 
821 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
836 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
973 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
788 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
814 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
645 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  37.36 
 
 
644 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  38.54 
 
 
736 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
786 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  38.12 
 
 
822 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
809 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
818 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
851 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
824 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>