More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  69.95 
 
 
745 aa  828    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  75.74 
 
 
705 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  60.44 
 
 
648 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  62.28 
 
 
722 aa  673    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  78.29 
 
 
706 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  63.08 
 
 
745 aa  712    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  77.9 
 
 
720 aa  995    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  63.14 
 
 
746 aa  709    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  74.3 
 
 
685 aa  906    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  74.92 
 
 
702 aa  902    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  77.98 
 
 
710 aa  966    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  76.74 
 
 
697 aa  942    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  77.9 
 
 
725 aa  995    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  77.09 
 
 
697 aa  985    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  74.92 
 
 
697 aa  917    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  100 
 
 
647 aa  1268    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  61.72 
 
 
719 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  69.48 
 
 
760 aa  855    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  77.83 
 
 
707 aa  966    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  76.74 
 
 
697 aa  945    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  77.98 
 
 
710 aa  966    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  76.74 
 
 
697 aa  942    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  51.95 
 
 
770 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
777 aa  623  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
670 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  52.75 
 
 
694 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  46.59 
 
 
740 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  48.2 
 
 
643 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  51.41 
 
 
725 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  49.54 
 
 
741 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  45.92 
 
 
686 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  46.41 
 
 
755 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  45.72 
 
 
674 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  45.72 
 
 
674 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  46.08 
 
 
674 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
674 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
674 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
680 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.34 
 
 
687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  49.16 
 
 
698 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  46.78 
 
 
721 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  44.57 
 
 
829 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  48.1 
 
 
703 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  51.25 
 
 
645 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  40.41 
 
 
679 aa  492  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
689 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  45.25 
 
 
678 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  42.55 
 
 
695 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  41.93 
 
 
698 aa  465  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
813 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.09 
 
 
695 aa  458  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
811 aa  458  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
813 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  39.62 
 
 
680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  43.72 
 
 
814 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
795 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  43.72 
 
 
814 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
795 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
889 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  41.19 
 
 
792 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  40 
 
 
732 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  41.69 
 
 
872 aa  438  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  41.41 
 
 
814 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
857 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  41.76 
 
 
768 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
817 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  41.76 
 
 
768 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
796 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  41.19 
 
 
814 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  42.57 
 
 
793 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  41.69 
 
 
818 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
818 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 
767 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
752 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  42.92 
 
 
806 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  42.08 
 
 
845 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
818 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
759 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
759 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.96 
 
 
735 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
942 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.46 
 
 
775 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  38.46 
 
 
683 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  37.25 
 
 
735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
823 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  40.12 
 
 
760 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
787 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
889 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
894 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.48 
 
 
954 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  39.05 
 
 
736 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.76 
 
 
753 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
802 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
895 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
802 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
758 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
824 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
810 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>