More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0629 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  49.08 
 
 		 687 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  73.68 
 
 		 695 aa  1027    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  93.68 
 
 		 697 aa  1244    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  100 
 
 		 698 aa  1415    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  47.9 
 
 		 695 aa  633  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  45.83 
 
 		 679 aa  578  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  42.82 
 
 		 683 aa  567  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  44.1 
 
 		 732 aa  553  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  44.12 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 		 643 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  42.98 
 
 		 674 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  42.98 
 
 		 674 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  40.92 
 
 		 829 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  41.84 
 
 		 740 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 674 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 674 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 		 674 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  40.08 
 
 		 721 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 777 aa  510  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  38.13 
 
 		 770 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 		 670 aa  505  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 		 755 aa  502  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  40.79 
 
 		 706 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  41.78 
 
 		 678 aa  492  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  40.56 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 702 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  40.56 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 725 aa  482  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  39.94 
 
 		 707 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  40.81 
 
 		 698 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.5 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  39.47 
 
 		 710 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  39.47 
 
 		 710 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 		 689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  40.8 
 
 		 725 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.91 
 
 		 697 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  39.91 
 
 		 697 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  40.65 
 
 		 705 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  40.06 
 
 		 697 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 741 aa  465  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.11 
 
 		 745 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  39.1 
 
 		 697 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  37.97 
 
 		 760 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 		 703 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 647 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.32 
 
 		 746 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  39.2 
 
 		 722 aa  445  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  37.75 
 
 		 745 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 719 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  37.54 
 
 		 768 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  37.54 
 
 		 768 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 767 aa  436  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  39.72 
 
 		 648 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  37.13 
 
 		 845 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  37.99 
 
 		 889 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 		 795 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 795 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  40.4 
 
 		 645 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 813 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 775 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  36.2 
 
 		 811 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  35.99 
 
 		 813 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 818 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 857 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 		 839 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 792 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  35.72 
 
 		 818 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 822 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  36.31 
 
 		 760 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  36.26 
 
 		 801 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  35.66 
 
 		 762 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 793 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 		 782 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 761 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  33.84 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.01 
 
 		 759 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  33.29 
 
 		 736 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.01 
 
 		 759 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 		 817 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  35.16 
 
 		 823 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  34.45 
 
 		 744 aa  364  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  34.39 
 
 		 645 aa  363  4e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  34.1 
 
 		 835 aa  364  4e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.46 
 
 		 797 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  34.14 
 
 		 816 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  33.99 
 
 		 846 aa  363  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  34.14 
 
 		 724 aa  362  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  33.43 
 
 		 780 aa  362  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  33.23 
 
 		 735 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 		 835 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 889 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 905 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 781 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  33 
 
 		 798 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>