More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2438 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  53.64 
 
 		 695 aa  758    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  100 
 
 		 687 aa  1392    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  46.69 
 
 		 721 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  49.46 
 
 		 697 aa  637    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  48.7 
 
 		 698 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  52.59 
 
 		 679 aa  718    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 674 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 674 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  46.23 
 
 		 674 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  46.23 
 
 		 674 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.51 
 
 		 695 aa  620  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  47.08 
 
 		 643 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 674 aa  621  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  46 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  47.34 
 
 		 680 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  44.51 
 
 		 829 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 680 aa  594  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 777 aa  594  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  44.33 
 
 		 740 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  47.41 
 
 		 732 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 		 689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 755 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  43.11 
 
 		 770 aa  561  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 678 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 		 698 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  41.02 
 
 		 720 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 		 694 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 703 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 725 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 725 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  42.15 
 
 		 697 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  41 
 
 		 707 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 697 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 697 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  40.28 
 
 		 710 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  40.28 
 
 		 710 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  42.23 
 
 		 705 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  39.77 
 
 		 697 aa  515  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  42.02 
 
 		 648 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.83 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 702 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.34 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 760 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 745 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 685 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  40.76 
 
 		 719 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  39.08 
 
 		 745 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  41.47 
 
 		 722 aa  492  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.21 
 
 		 746 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  38.41 
 
 		 741 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  41.72 
 
 		 645 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 		 793 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 		 894 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 857 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 		 768 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 		 768 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 		 767 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 813 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 845 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 818 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 813 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  36.57 
 
 		 795 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  36.44 
 
 		 811 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  36.43 
 
 		 795 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  37.79 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  37.43 
 
 		 835 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 760 aa  445  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 		 817 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  36.39 
 
 		 823 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  36.57 
 
 		 796 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 		 839 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  37.61 
 
 		 889 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 889 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 		 781 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 		 758 aa  429  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 775 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  36.03 
 
 		 806 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 		 781 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  37.6 
 
 		 736 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 		 776 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  36.38 
 
 		 735 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  35.58 
 
 		 753 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 		 814 aa  425  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  35.79 
 
 		 752 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 		 786 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  34.58 
 
 		 823 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  34.59 
 
 		 822 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  37.52 
 
 		 824 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 		 818 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  36.64 
 
 		 759 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  36.64 
 
 		 759 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 		 755 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  35.57 
 
 		 787 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  35.2 
 
 		 905 aa  414  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>