More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1713 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  68.83 
 
 		 813 aa  1118    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 814 aa  1632    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  69.21 
 
 		 792 aa  1081    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  53.32 
 
 		 775 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  68.34 
 
 		 817 aa  1068    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  49.04 
 
 		 793 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  51.22 
 
 		 845 aa  757    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  47.95 
 
 		 806 aa  644    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  68.31 
 
 		 811 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  45.91 
 
 		 857 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 814 aa  1632    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  53.14 
 
 		 768 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  69.76 
 
 		 818 aa  1104    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  53.75 
 
 		 795 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  69.89 
 
 		 813 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  53.42 
 
 		 818 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  53.62 
 
 		 795 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  53.14 
 
 		 768 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  53.62 
 
 		 796 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 767 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  71.02 
 
 		 889 aa  981    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  68.63 
 
 		 823 aa  1102    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.21 
 
 		 954 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.79 
 
 		 857 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.86 
 
 		 889 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.89 
 
 		 818 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.42 
 
 		 942 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 		 894 aa  572  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.37 
 
 		 889 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 821 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 		 836 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  40.73 
 
 		 753 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 752 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.04 
 
 		 758 aa  549  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  40.44 
 
 		 815 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  47.04 
 
 		 804 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 837 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 643 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.44 
 
 		 798 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 		 795 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  39.62 
 
 		 750 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  39.36 
 
 		 797 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 		 816 aa  529  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  40.37 
 
 		 817 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 		 976 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 		 885 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  41.41 
 
 		 803 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  46.41 
 
 		 872 aa  529  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  41.1 
 
 		 849 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 760 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.39 
 
 		 805 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  40.42 
 
 		 797 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  43.87 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.26 
 
 		 806 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  45.71 
 
 		 814 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  43.27 
 
 		 829 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 		 820 aa  521  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 797 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 		 838 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  43.87 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.07 
 
 		 806 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 		 786 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 		 674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 747 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.26 
 
 		 806 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 		 851 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 905 aa  517  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 		 674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  40.15 
 
 		 837 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.35 
 
 		 826 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 		 827 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  45.69 
 
 		 788 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  42.45 
 
 		 735 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 		 793 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 		 755 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  47.35 
 
 		 833 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 814 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 833 aa  512  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 		 821 aa  515  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 773 aa  515  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 		 680 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  39.33 
 
 		 740 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  38.23 
 
 		 742 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.94 
 
 		 805 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  41.15 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 831 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  38.94 
 
 		 805 aa  515  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  43.14 
 
 		 735 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 		 755 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 		 777 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  45.99 
 
 		 818 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 		 801 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 737 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  43.65 
 
 		 644 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>