More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2740 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  59.88 
 
 
721 aa  813    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  62.21 
 
 
698 aa  799    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  67.36 
 
 
674 aa  891    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  65.74 
 
 
643 aa  843    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  49.14 
 
 
777 aa  647    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  59.73 
 
 
829 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
689 aa  1363    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  67.36 
 
 
674 aa  891    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  51.17 
 
 
670 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  66.92 
 
 
674 aa  886    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  54.29 
 
 
694 aa  663    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  54.4 
 
 
680 aa  758    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  61.85 
 
 
703 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  66.77 
 
 
674 aa  896    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  56.25 
 
 
686 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  53.11 
 
 
740 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  60.95 
 
 
678 aa  777    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  66.92 
 
 
674 aa  886    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  53.22 
 
 
755 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  51.2 
 
 
770 aa  622  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  53.91 
 
 
725 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  50.85 
 
 
741 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.31 
 
 
687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  43.92 
 
 
679 aa  566  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  55.3 
 
 
645 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  51.55 
 
 
648 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
695 aa  540  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  45.97 
 
 
706 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
722 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.74 
 
 
745 aa  523  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
768 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  48.32 
 
 
719 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
768 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
710 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  49.38 
 
 
745 aa  521  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.03 
 
 
746 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
767 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  44.71 
 
 
710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  46.74 
 
 
707 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  45.6 
 
 
697 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
697 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
760 aa  512  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 
725 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 
720 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
793 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.89 
 
 
697 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.6 
 
 
697 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
697 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
795 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  46.65 
 
 
705 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  44.33 
 
 
845 aa  505  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
795 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  42.79 
 
 
813 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  41.93 
 
 
818 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
806 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
813 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
811 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
796 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  45.96 
 
 
775 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  45.92 
 
 
685 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
818 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
647 aa  487  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  40.8 
 
 
698 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
857 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
697 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  40.73 
 
 
680 aa  480  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  40.17 
 
 
889 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.35 
 
 
695 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
792 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
823 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
702 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  42.02 
 
 
732 aa  465  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
814 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
814 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  40.09 
 
 
817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
806 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
755 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
799 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
846 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 
786 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  38.22 
 
 
822 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 
795 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
787 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
809 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  41.19 
 
 
827 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  36.82 
 
 
683 aa  432  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.2 
 
 
894 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.58 
 
 
735 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
841 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
836 aa  429  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
762 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
761 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
818 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  38.12 
 
 
801 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
782 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
736 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
793 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
868 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
846 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>