More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1895 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1895  GTP-binding protein Era  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.157383  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
290 aa  227  2e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  38.93 
 
 
293 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 
301 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 
300 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 
298 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 
298 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  40 
 
 
301 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 
294 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 
303 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
310 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 
489 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  36.73 
 
 
299 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 
299 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 
299 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
303 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 
297 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 
300 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 
298 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 
303 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 
299 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 
302 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  38.73 
 
 
302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  37.75 
 
 
303 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 
451 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 
299 aa  188  9e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
313 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  36.82 
 
 
302 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 
306 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 
337 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
313 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.31 
 
 
324 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
312 aa  185  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 
314 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 
302 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  36.75 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.15 
 
 
301 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  35.23 
 
 
308 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  35.84 
 
 
301 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  34.58 
 
 
294 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  36.7 
 
 
311 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 
315 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 
303 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 
301 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 
301 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
301 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  34.25 
 
 
449 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  34.23 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  34.3 
 
 
313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  37.18 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 
298 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  36.13 
 
 
310 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  36.03 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 
308 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
301 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 
310 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  35.25 
 
 
293 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  36.54 
 
 
310 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  36.91 
 
 
300 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
295 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
301 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  34.68 
 
 
305 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 
318 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  36.24 
 
 
303 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
307 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  34.56 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  36.33 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  36.54 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 
298 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  36.24 
 
 
315 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  32.99 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  36.15 
 
 
319 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  36.05 
 
 
297 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 
308 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  34.12 
 
 
301 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  35.33 
 
 
303 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  36.04 
 
 
299 aa  170  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  34.36 
 
 
296 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 
468 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  34.58 
 
 
315 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 
296 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  32.8 
 
 
319 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
312 aa  168  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  33.11 
 
 
310 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>