More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3384 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  70.39 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  67.08 
 
 		 314 aa  421  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  70.72 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  70.87 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  67.99 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  69.97 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  67.21 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  68.52 
 
 		 375 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  67.67 
 
 		 298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  68.83 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  66.36 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  68.75 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  64.26 
 
 		 299 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  67.86 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  66.67 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  63.82 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  64.77 
 
 		 300 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  64.29 
 
 		 322 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  65.56 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  64.84 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  63.76 
 
 		 315 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  64.22 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  66.24 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  63.19 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  62.54 
 
 		 303 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  63.31 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  60.33 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  64 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  65.89 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  60.97 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  60 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  58.97 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  60.36 
 
 		 272 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  50.31 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  49.24 
 
 		 353 aa  292  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  47.68 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 		 308 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  43.83 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 		 303 aa  248  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  44.26 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  47.54 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  45.51 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  42.53 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.38 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.28 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  39.29 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 337 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.54 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 451 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  44.12 
 
 		 449 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>