More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1629 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 453 aa  903    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.45 
 
 		 470 aa  326  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 		 581 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.82 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.15 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 		 467 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.2 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  36.96 
 
 		 584 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 		 466 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.17 
 
 		 562 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.32 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.87 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 478 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.74 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 		 467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 		 465 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.98 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.68 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 		 473 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.99 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.21 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.64 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.62 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 		 480 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.14 
 
 		 585 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.68 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 		 462 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 		 482 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 		 467 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.28 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.79 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.51 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  37.82 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.12 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 		 468 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.11 
 
 		 471 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.68 
 
 		 468 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.98 
 
 		 468 aa  272  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 466 aa  272  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.1 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 		 477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.84 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.89 
 
 		 539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  37.5 
 
 		 468 aa  269  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 		 585 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.75 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.78 
 
 		 466 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.35 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>