240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0557 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0557  phospholipase D family protein  100 
 
 
474 aa  991    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  22.84 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  24.76 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  22.67 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  22.67 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.08 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.64 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.26 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  24.41 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  21.29 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.54 
 
 
541 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  23.84 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 
480 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  22.25 
 
 
483 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  23.6 
 
 
479 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  23 
 
 
475 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 
483 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.39 
 
 
486 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0692  cardiolipin synthase  22.25 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  22.77 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  24.53 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  22.66 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 
505 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  22.22 
 
 
505 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.87 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  21.78 
 
 
477 aa  60.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.41 
 
 
483 aa  60.1  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  24.77 
 
 
479 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.86 
 
 
474 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.5 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.99 
 
 
508 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  23.73 
 
 
481 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  22.58 
 
 
412 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  24.31 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  24.22 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  24.53 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.49 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.44 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  22.43 
 
 
479 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  22.84 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.67 
 
 
476 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  24.23 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  22.46 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  22.57 
 
 
490 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  22.66 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  21.26 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  22.67 
 
 
476 aa  57  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  22.8 
 
 
555 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  23.6 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.1 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.34 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  21.99 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  26.09 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  26.09 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl626  cardiolipin synthetase  20.66 
 
 
521 aa  55.1  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.86 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  21.45 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.49 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  22.58 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  23.45 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  21.05 
 
 
478 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1905  phospholipase D/transphosphatidylase  21.28 
 
 
394 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  23.4 
 
 
484 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  25.43 
 
 
484 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  22.49 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  21 
 
 
490 aa  53.9  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 
482 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  27.44 
 
 
420 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  21.21 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2883  cardiolipin synthetase  21.4 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  23.56 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  20.44 
 
 
518 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.06 
 
 
478 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.89 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0150  cardiolipin synthetase, putative  25.52 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.926431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  21.48 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  20.44 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.9 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  23.63 
 
 
532 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  23.3 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1543  phospholipase D/transphosphatidylase  21.45 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0120705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  22.88 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  27.44 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  22.39 
 
 
509 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  21.8 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  21.56 
 
 
509 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.97 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  25.14 
 
 
481 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  22.54 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  24.73 
 
 
502 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  23.78 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  23.1 
 
 
489 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  22.58 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  23.62 
 
 
509 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  19.64 
 
 
492 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>