87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13180 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  100 
 
 		 590 aa  1068    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  63.26 
 
 		 636 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  51.52 
 
 		 760 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  59.16 
 
 		 582 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  60.1 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  57.33 
 
 		 613 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  50.69 
 
 		 645 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  53.93 
 
 		 975 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  50 
 
 		 551 aa  296  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  53.06 
 
 		 3787 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  54.8 
 
 		 448 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  44.81 
 
 		 3295 aa  277  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  51.3 
 
 		 1457 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  54.36 
 
 		 3166 aa  250  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  52.68 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  50.41 
 
 		 1013 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  54.03 
 
 		 2532 aa  226  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  56.83 
 
 		 580 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  73.56 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  47.97 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  65.12 
 
 		 655 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  48.8 
 
 		 2472 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  54.3 
 
 		 443 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  57.14 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  41.11 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  50.3 
 
 		 423 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  53.85 
 
 		 409 aa  134  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  55.63 
 
 		 403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  53.9 
 
 		 350 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  53.9 
 
 		 350 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  48.05 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  47.4 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  49.7 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  49.13 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  55.28 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  56.47 
 
 		 391 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  43.71 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  57.62 
 
 		 393 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  46.94 
 
 		 391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  56.41 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  51.3 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.14 
 
 		 479 aa  104  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  52.82 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  51.55 
 
 		 394 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  52.98 
 
 		 394 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.64 
 
 		 391 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  51.01 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  41.45 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  28.57 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  36.95 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  36.95 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  41.83 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  29.76 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  36.49 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  29.27 
 
 		 173 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  29.52 
 
 		 176 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  39.25 
 
 		 213 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  35.26 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  50.85 
 
 		 185 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  28.31 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  42.73 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  40 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  36.94 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  30.2 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  38.78 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.5 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  34.21 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  37.75 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  34.59 
 
 		 368 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  35.03 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  32.47 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  35.03 
 
 		 435 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  39.05 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  25.93 
 
 		 349 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.56 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  38.06 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  53.03 
 
 		 278 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  53.03 
 
 		 278 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 493 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.36 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 		 900 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.78 
 
 		 734 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  27.43 
 
 		 384 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  35.26 
 
 		 524 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>